Nexus 5 の MOB31E の Factory Image が DL 出来る様になったので
焼いて root を取ってみたです。

Androidセキュリティパッチレベルは 2016年9月6日に・・ベースバン
ドは変わらず、ビルド番号は MOB31E になりました。

root はいつもと同じやり方で（adb が使える様にしておいて TWRP を
fastboot で焼いて SuperSu を TWRP でインストール）取れましたね。

TWRP: twrp-3.0.2-0-hammerhead.img
SuperSu: SuperSU-v2.78-201609011115.zip